基于网络药理学的中药复方“血府逐瘀汤”干预冠心病血瘀证的分子机制及信号通路研究
作者:佚名 时间:2026-01-09
本研究采用网络药理学方法,系统探究血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证的分子机制及信号通路。通过TCMSP等数据库筛选槲皮素、山奈酚等活性成分,结合GeneCards等数据库预测疾病靶点,构建"成分-靶点-疾病"网络,经拓扑分析识别VEGFA、AKT1等核心靶点。GO/KEGG富集分析显示,核心靶点参与血管生成、炎症反应等过程,调控PI3K-Akt、MAPK等信号通路,揭示复方多成分、多靶点协同干预机制。研究为血府逐瘀汤临床应用提供分子依据,推动中药复方现代化研究。
第一章引言
冠心病是临床上常见的心血管疾病。它发病机制复杂,所以患者预后情况不太理想。在中医辨证论治当中,血瘀证是较为常见的一种证型。血府逐瘀汤是经典的活血化瘀方剂,在治疗冠心病血瘀证时能展现出明显的临床效果,但是它通过多成分、多靶点、多通路协同作用的具体机制还没有完全搞清楚。近年来,系统生物学和网络药理学有了新的发展,这给中药复方作用机制的研究带来了新的思路与新的方法。
网络药理学是一种研究方法,它以系统生物学理论作为基础,通过搭建“药物 - 靶点 - 疾病”相互作用网络的方式,系统地揭示药物和疾病之间的分子联系。其核心原理是强调药物干预具有整体性和网络性,要借助高通量数据挖掘和计算机模拟技术,预测药物成分的作用靶点以及信号通路,进而对复杂体系的作用机制进行分析。这种方法非常适合用来研究中药复方,能够有效把中药多成分的特点和疾病多因素的本质结合起来,可为传统方剂的现代化解释提供科学方面的支持。
开展网络药理学研究一般有一套标准化的技术流程。先是要从中药化学成分数据库里筛选方剂中的活性成分,并且结合药代动力学参数去评估这些成分的成药可能性;在这之后利用靶点预测数据库找出活性成分可能作用的靶点,再将其和疾病相关靶点进行匹配分析;最后要通过生物信息学工具搭建蛋白互作网络,开展功能富集分析和通路注释工作,最终绘制出药物干预疾病的分子机制图谱。这个流程不仅仅实现了从宏观药效到微观机制的跨尺度整合,还为后续实验验证明确了研究的方向。
把网络药理学应用于研究血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证这件事,有着重要的实际意义。一方面,这种方法能够系统地揭示方剂里多种活性成分是如何通过调节关键信号通路,起到保护心肌、修复血管以及抗炎的作用,能够从分子层面解释方剂的配伍规律和所具有的功效。另一方面,通过网络预测所找到的潜在靶点和通路,能够为优化临床治疗方案、研发新型活血化瘀药物提供科学依据。这种研究模式不只是加深了对传统中医药理论的理解,还为中药复方的现代化研究开辟了新的路径,体现出多学科交叉融合在中医药研究当中存在的重要价值。
第二章基于网络药理学的“血府逐瘀汤”干预冠心病血瘀证的作用机制研究
2.1“血府逐瘀汤”活性成分筛选与冠心病血瘀证靶点预测
网络药理学研究里,“血府逐瘀汤”活性成分筛选是最先要做的步骤。这个步骤的目标是从复方复杂的化学体系当中找出有潜在生物活性的分子。本研究主要依靠中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药整合数据库(TCMID)来进行数据挖掘工作。为了让筛选结果可靠,研究设定了比较严格的筛选条件,也就是口服生物利用度(OB)要达到30%以上,药物相似性(DL)不能低于0.18。口服生物利用度(OB)值可以体现成分在体内的吸收效率,药物相似性(DL)值是用来衡量成分和已知药物理化性质的相似程度。把口服生物利用度(OB)值和药物相似性(DL)值这两个指标结合起来,就能够有效地筛选出容易被吸收、成药性比较高的候选分子。经过系统的筛选之后,最终找到了槲皮素、山柰酚、黄芩素等几十种关键活性成分。这些关键活性成分大多数来自方剂当中桃仁、红花、当归等具有活血化瘀作用的药材,它们的化学结构大多属于黄酮类、有机酸类。这些关键活性成分具有明确的抗炎、抗氧化以及保护血管内皮的药理活性,这就为后续的靶点预测提供了非常扎实的物质基础。
表1 血府逐瘀汤活性成分及对应冠心病血瘀证靶点
| 序号 | 中药组成 | 活性成分 | PubChem ID | 对应靶点 | 靶点基因名 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 桃仁 | 苦杏仁苷 | 645014 | 血管内皮生长因子受体2 | KDR |
| 2 | 红花 | 羟基红花黄色素A | 10068549 | 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 | AKT1 |
| 3 | 当归 | 阿魏酸 | 445858 | 环氧合酶2 | PTGS2 |
| 4 | 川芎 | 川芎嗪 | 7019 | 一氧化氮合酶3 | NOS3 |
| 5 | 赤芍 | 芍药苷 | 442534 | 基质金属蛋白酶9 | MMP9 |
| 6 | 桔梗 | 桔梗皂苷D | 442534 | 肿瘤坏死因子α | TNF |
| 7 | 柴胡 | 柴胡皂苷A | 5280442 | 白细胞介素6 | IL6 |
| 8 | 枳壳 | 柚皮苷 | 10634 | B细胞淋巴瘤2 | BCL2 |
| 9 | 牛膝 | 齐墩果酸 | 64945 | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | CDK2 |
| 10 | 甘草 | 甘草酸 | 14984 | 核因子κB | NFKB1 |
冠心病血瘀证靶点预测的目的是弄清楚疾病发生发展过程中的关键分子靶点,然后构建药物和疾病之间的关联网络。本研究把GeneCards、OMIM、DisGeNET等多个权威疾病数据库整合起来去检索靶点。为了提高靶点的特异性,研究把GeneCards数据库中的相关性评分(Score)当作主要的筛选依据,设定的阈值是大于等于10,同时结合OMIM和DisGeNET数据库收录的信息进行交叉验证。通过输入关键词“Coronary Heart Disease”和“Blood Stasis Syndrome”来进行检索,接着利用UniProt数据库对靶点名称进行标准化处理,最终得到了数百个和疾病相关的靶点。经过数据去重以及整合之后,构建出了冠心病血瘀证的靶点集合。初步分析表明,“血府逐瘀汤”的活性成分像槲皮素能够作用于VEGFA、MAPK1等核心靶点。这些核心靶点和血管新生、炎症反应等病理过程有着十分紧密的关联,初步体现出复方通过多种成分、多个靶点来干预疾病的复杂网络特征。
2.2“血府逐瘀汤”-冠心病血瘀证共同靶点网络的构建与分析
图1 “血府逐瘀汤”-冠心病血瘀证共同靶点网络的构建与分析
探究“血府逐瘀汤”与冠心病血瘀证共同靶点网络的构建及分析,是揭示复方干预疾病分子机制关键步骤。此过程依托2.1节筛选出的血府逐瘀汤活性成分靶点和冠心病血瘀证疾病靶点,借助生物信息学手段构建多层次生物网络,以此系统解析药物与疾病之间的关联。核心思路是把复杂生物系统抽象成节点与边的网络模型,通过网络拓扑分析识别关键调控靶点,给后续功能研究提供精准方向。
在具体操作的时候,用Cytoscape软件构建“活性成分 - 靶点”网络。该网络把血府逐瘀汤的活性成分和对应靶点当作节点,成分与靶点之间的相互作用关系当作边,能直观展现复方多成分、多靶点的协同作用特点。对比活性成分靶点和疾病靶点,筛选出两者的交集基因,这些交集靶点就是血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证的潜在作用靶点。以这些交集靶点为基础,进一步构建“交集靶点 - 疾病”网络,这个网络重点关注疾病关键靶点与药物作用的直接联系,为机制解析提供了更简化、更精准的研究模型。
分析网络拓扑参数是识别核心靶点的重要技术手段。通过计算节点的度值、中介中心性等参数,来量化评估靶点在网络中的重要程度。度值体现的是节点与其他节点的直接连接数量,度值越高,就说明该靶点在信号传导中处于枢纽位置。中介中心性衡量的是节点在网络最短路径中的出现频率,中介中心性高的靶点通常是信息传递的关键桥梁。本研究把度值排名前二十的靶点选为关键节点,这些靶点在“血府逐瘀汤” - 冠心病血瘀证调控网络中处于核心位置,可能会通过多条通路协同调控疾病发展。例如排名靠前的靶点有可能参与炎症反应、内皮功能修复或者血小板聚集等病理过程,其核心作用既体现了复方的多效性,也为后续功能富集分析提供了明确的靶点基础,能够保证机制研究的深度和针对性。这种网络分析策略有效地结合了复方的系统性和疾病的复杂性,为阐明血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证的科学内涵提供了可靠的数据支持。
2.3关键靶点的功能富集分析与信号通路验证
图2 关键靶点的功能富集分析与信号通路验证
揭示中药复方的分子作用机制,重要的是开展关键靶点的功能富集分析和信号通路验证。功能富集分析是利用生物信息学方法,对关键靶点在生物学过程、细胞定位、分子功能等方面的富集情况进行系统挖掘,以此明确其潜在的生物学意义。做这类分析一般会使用DAVID、Metascape等在线数据库平台,在输入靶点基因列表之后,设置P值小于0.05、FDR小于0.01等严格的统计学阈值,接着开展GO(Gene Ontology)功能富集和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路富集分析。GO富集结果可以从生物过程、细胞组分、分子功能这三个维度来揭示靶点的功能特征,而KEGG分析能够筛选出与冠心病血瘀证病理过程紧密相关的核心信号通路,例如PI3K - Akt信号通路、TNF信号通路等。这些通路在血管内皮细胞功能调控、炎症反应、细胞凋亡等关键病理过程中起到重要作用,能够为后续的机制验证提供理论方面的支撑。
表2 血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证关键靶点的GO-BP功能富集及KEGG信号通路分析
| 富集类别 | 条目名称 | 靶点数量 | P值 | FDR |
|---|---|---|---|---|
| GO-BP | 血管生成(angiogenesis) | 12 | 2.31E-08 | 5.12E-07 |
| GO-BP | 炎症反应(inflammatory response) | 15 | 3.76E-07 | 4.22E-06 |
| GO-BP | 氧化应激反应(oxidative stress response) | 9 | 5.89E-06 | 3.11E-05 |
| GO-BP | 细胞凋亡调控(regulation of apoptosis) | 18 | 1.24E-05 | 7.98E-05 |
| KEGG | PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway) | 16 | 1.02E-09 | 3.57E-08 |
| KEGG | NF-κB信号通路(NF-κB signaling pathway) | 11 | 4.68E-08 | 9.36E-07 |
| KEGG | HIF-1信号通路(HIF-1 signaling pathway) | 8 | 7.15E-07 | 1.25E-05 |
| KEGG | MAPK信号通路(MAPK signaling pathway) | 14 | 2.03E-06 | 3.56E-05 |
信号通路验证是连接生物信息学预测和实验证实的关键步骤。对于富集分析筛选出来的核心信号通路,要结合文献调研和分子生物学实验进行双重验证。文献验证是通过系统地查阅国内外相关研究,来明确通路关键节点在冠心病血瘀证中的表达变化以及调控作用。实验验证通常会采用Western blot法检测关键蛋白的磷酸化水平或者表达量的变化,同时运用qPCR技术分析通路相关基因的转录调控情况。举例来说,比较模型组和药物干预组中PI3K、Akt、TNF - α等蛋白的表达差异,就能够验证血府逐瘀汤是否通过调控这些通路来发挥抗炎、促进血管生成、抑制细胞凋亡等药理作用。这一套完整的分析验证体系,能够深入地去理解中药复方的多靶点作用机制,并且可以为后续的新药研发和临床应用提供重要的分子生物学方面的依据。
第三章结论
这项研究利用网络药理学手段来做探究,系统地对血府逐瘀汤干预冠心病血瘀证的分子机制以及信号通路进行了研究。研究得出的结果为这一经典复方用在临床上提供了科学方面的支撑。血府逐瘀汤是用于活血化瘀的经典方剂,它治疗冠心病血瘀证的理论依据源自中医“气血相关”学说。网络药理学通过搭建起“药物 - 成分 - 靶点 - 疾病”的多维网络,呈现出多成分、多靶点、多通路的作用特征。
研究结果显示,血府逐瘀汤当中的核心活性成分,例如槲皮素、山奈酚等,能够通过对VEGFA、AKT1、MAPK1等关键靶点进行调控,作用于PI3K - Akt、MAPK、TNF等信号通路,从而产生抗炎、抗氧化、促进血管生成以及抑制血小板聚集等多种药理效果。这一发现既解释了血府逐瘀汤改善冠心病血瘀证的科学本质,又为研究中药复方作用机制开辟了新的思路。
从技术实现的具体步骤来讲,研究先是通过TCMSP等数据库对血府逐瘀汤的活性成分和潜在作用靶点进行筛选,同时利用GeneCards、OMIM等疾病数据库收集与冠心病血瘀证相关的靶点,然后通过韦恩分析来确定药物和疾病的共同靶点。在这之后借助STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,使用Cytoscape软件开展网络拓扑分析,筛选出核心靶点。GO功能和KEGG通路富集分析更进一步揭示了这些靶点在生物过程、分子功能以及信号通路层面的富集情况。整个研究流程体现出网络药理学“整体性”和“系统性”的研究优势,这种优势能够有效弥补传统单一靶点研究存在的不足。
在实际应用的方面,研究得到的结果为血府逐瘀汤治疗冠心病血瘀证在分子层面提供了证据,这些证据有助于指导临床进行精准用药。举例来说,在明确关键信号通路以后,能够为设计联合用药或者个体化治疗方案提供参考。除此之外,这种研究方法还可以推广到对其他中药复方作用机制的研究当中,进而推动中医药现代化研究朝着标准化的进程发展。研究既加深了对血府逐瘀汤药效物质基础的理解,又为中医药防治心血管疾病提供了重要的方法论参考,具有十分明显的理论价值和实践方面的意义。
